Java for OS X 2013-003が来てたので、ソフトウェア・アップデート経由でインストールしました。
Java for OS X 2013-003 で Java SE 6 を 1.6.0_45 にアップデートすることにより、セキュリティ、信頼性、および互換性が向上します。
Java for OS X 2012-006 がインストールされていないシステムにこのアップデートを適用すると、Java SE 6 アプレットプラグインが無効になります。Web ページでアプレットを使用するには、“プラグインが見つかりません”ラベルの領域をクリックして、Oracle の提供する Java アプレットプラグインの最新バージョンをダウンロードしてください。
このアップデートをインストールする前に、Web ブラウザと Java アプリケーションを終了してください。
このアップデートについて詳しくは、http://support.apple.com/kb/HT5682?viewlocale=ja_JP をご覧ください。
このアップデートのセキュリティコンテンツについては、http://support.apple.com/kb/HT1222?viewlocale=ja_JP をご覧ください。